1、高负荷：制药废水的COD主要来自于反应物、溶剂、产品、副产品。COD数值普遍在几万至几十万，且B/C比值＜0.1，生化性差，难以进行常规的生化处理。

2、高毒性：制药废水这种的污染物因子包括抗生素、DMF、THF、丙酮、氯仿、苯类，抑制微生物的活性。

3、高盐分：废水来源为原料、合成反应副产物等。Cl-、SO42-含量>20000 ppm；属于混盐。高盐分会使得微生物细胞脱水失活甚至死亡；超过常规生化处理的极限；使废水密度增加，加速污泥上浮；腐蚀设备

4、复杂性：由于制药行业的特殊性，生产产品不同会导致废水的水质变化大。

常用污水处理工艺流程：

1. 抗生素污水处理流程：污水→调节池→厌氧池→接触氧化池→气浮装置→UASB反应器→接触氧化池→辐流沉淀池→达标排放

2. 合成药物生产污水处理流程：污水→格栅→调节池→酸化池→CASS反应池→达标排放

3. 中药污水处理工艺流程：污水→格栅→调节池→SBR反应池→达标排放

污水处理工艺特点介绍：

1. 节省能源消耗：生物硝化、脱销所需的氧量，主要包括消化过程、内源呼吸和降解有机物时的需氧量。A/O工艺在脱销的同时降解有机物，使需氧量大大减少，是节能型的生物处理系统。

2. 污泥沉降性能好：为了维护较高的消化率，反应停留时间笔普通活性污泥法长，会发生微生物内源呼吸，污泥增长率低，剩余污泥量少，消化过程高，沉降性能好。

3. 节省水处理药剂：在A/O工艺中，脱销过程脱除1mg/l的NO3-N可产程3.75mg/l的碱度，硝化过程硝化1mg/l的NH4-N需消耗7.141mg/l的碱度，整个系统的碱度可以互相弥补，不必加碱中和，苑污水中的有机物作为脱销时的氢供给体，不用外加碳源。

4. 缺氧池在前，污水中的有机碳被反硝化菌所利用，可减轻其后好氧池的有机负荷。同时缺氧池中进行的反硝化反应产生的碱度可以补偿好氧池中进行硝化反应对碱度的需求。

5. A/O工艺的好氧池在缺氧池之后，可以使反硝化残留的有机污染物得到进一步去除，提高出水水质。